Écologie microbienne et interactions micro-organismes-hôtes

1. Le microbiote désigne l'ensemble des micro-organismes (bactéries, champignons, virus) qui vivent dans un environnement spécifique (ex: intestin).
2. Le microbiome désigne l'ensemble des gènes de ces micro-organismes.

💡 À retenir : Microbiote = les êtres vivants ; Microbiome = leur matériel génétique.

1. Cela arrive quand le système immunitaire de l'hôte est affaibli (immunosuppression).
2. Ou quand la barrière physique est rompue (plaie, chirurgie).
3. On parle alors de bactéries opportunistes.

💡 À retenir : Un micro-organisme opportuniste profite d'une faille dans les défenses de l'hôte pour devenir pathogène.

1. Oui, elles aident à la digestion des fibres complexes.
2. Elles synthétisent des vitamines (ex: Vitamine K).
3. Elles occupent l'espace, empêchant les bactéries pathogènes de s'installer.

💡 À retenir : Le microbiote intestinal est un véritable organe métabolique et protecteur.

La symbiose est une interaction biologique étroite et durable entre deux organismes d'espèces différentes, où les deux partenaires tirent un bénéfice.

💡 À retenir : Symbiose = Gagnant-Gagnant.

C'est une communauté de micro-organismes fixés sur une surface, entourés d'une matrice de polymères qu'ils sécrètent eux-mêmes.

💡 À retenir : Le biofilm protège les bactéries contre les antibiotiques et le système immunitaire.

C'est un déséquilibre qualitatif ou quantitatif de la composition du microbiote, souvent associé à des pathologies (obésité, maladies inflammatoires).

💡 À retenir : Dysbiose = Perte de l'équilibre microbien.

1. Pathogène strict : provoque toujours une maladie chez un hôte sain.
2. Opportuniste : ne provoque une maladie que si l'hôte est immunodéprimé.

💡 À retenir : L'opportuniste attend que l'hôte soit "faible".

Le pH est un facteur abiotique majeur. Un pH acide (ex: peau, vagin) sélectionne les espèces acidophiles et inhibe la croissance de nombreux pathogènes.

💡 À retenir : Le pH est une barrière chimique naturelle.

Par un mécanisme appelé "Quorum Sensing", où elles sécrètent des molécules signal qui leur permettent de coordonner leur comportement en fonction de leur densité.

💡 À retenir : Quorum sensing = communication chimique bactérienne.

C'est un micro-organisme qui vit aux dépens de son hôte sans lui causer de tort, mais sans lui apporter de bénéfice direct non plus.

💡 À retenir : Commensalisme = "manger à la même table" sans gêner.

Il forme une barrière physique et chimique (sécrétion d'acides gras) qui empêche la colonisation par des bactéries pathogènes exogènes.

💡 À retenir : Le microbiote est notre première ligne de défense.

C'est l'étape où le micro-organisme s'établit et se multiplie sur un site de l'hôte sans nécessairement provoquer de symptômes.

💡 À retenir : Colonisation n'est pas synonyme d'infection.